Ichigo Kurosaki siempre ha tenido la capacidad de ver fantasmas, pero su vida cambia radicalmente cuando conoce a Rukia Kuchiki, una Segadora de Almas (Shinigami). Durante un enfrentamiento contra un Hollow devorador de almas, Rukia resulta herida y traspasa sus poderes a Ichigo para que pueda proteger a su familia. Convertido en un Shinigami sustituto, Ichigo se verá envuelto en una guerra ancestral entre la Sociedad de Almas y fuerzas oscuras, mientras descubre los secretos ocultos tras su propio linaje.
La Saga de la Guerra de Sangre de Mil Años es la septima y última saga del manga de Bleach, donde trascurrirá el arco final de Bleach.
Al principio de este nuevo arco, se puede apreciar el trabajo intensivo de la duodécima división, tratando de averiguar la extraña desaparición de hollows en distintas partes del mundo de los vivos.
La décimo segunda división investigando la desaparicion de hollows. Luego aparece el shinigami encargado de vigilar Pueblo de Karakura Zennosuke Kurumadani, quien recluta para una misión en Karakura a Yuki Ryūnosuke y a su amiga Shino.
En el momento en que llegan se puede ver la sombra de un sujeto sospechoso. Luego de llegar Yuki, Shino y Zennosuke se separan, y Yuki es atacado por un hollow, del cual logra escapar, solo para ver como su amiga esta a punto de ser asesinada por un grupo de hollows. Yuki trata de hacerles frente, pero no lo consigue ya que son muy fuertes para el.
Y en el momento en que Yuki esta por ser rematado por un hollow, llega en su rescate Ichigo, presentándose nuevamente como shinigami sustituto y derrotando al hollow, al mismo tiempo que vuelve a aparecer el sujeto sospechoso.
Luego de que Ichigo intentara seguir eliminado a los hollows, Uryu se le adelanta y dispara unas flechas que casi lo golpean, por lo que comienzan a discutir.
Uryu, Ichigo, Orihime y Chad se enfrentan a los hollows.
Dos días después de la batalla con los hollows, aparecen Hiyori y Risa saliendo de los baños públicos, ellas mencionan el estado de dos de los Visored que permanecieron en el mundo de los vivos, Love y Hachi.
Ya en la casa de Ichigo, Yuki despierta y ve a Ichigo que le dice que ya que esta despierto de puede ir, luego aparece Orihime trayendo pan, y tras ella Uryu y Chad. Ichigo sorprendidos molesta preguntando como es que entraron sin siquiera llamar al timbre, Uryu le responde que Yuzu los dejo entrar y comienzan a discutir. Yuki grita aterrorizado recordando que Ichigo es la persona que lo salvó de los hollows y luego se acuerda de Shino, y se pregunta a Ichigo y a los demas a cerca de su estado.
Luego se ve a Ikkaku Madarame y a Yumichika corriendo, y este último le pregunta a su compañero que si tiene noticias, este le responde que sí, y que la gente del rukongai no puede estar desapareciendo así como así, y que no sabe lo que esta pasando pero no deben subestimar a su División.
Ichigo le pregunta su nombre a Yuki, pero quién responde es el sujeto extraño que había aparecido durante el ataque de los hollow y se presenta como Ebern Asguiaro, quién al parecer es un Arrancar.
Después de Ebern se niega a bajarse de la cama, Ichigo le da una patada y lo manda por la ventana. Ichigo y los demás, discuten a cerca de la identidad Ebern, que por su apariencia, señalaron que se trataba de un Arrancar. Inmediatamente, Ichigo se dispone a enfrentar a Ebern y lo llevó lejos de la casa, los demás quedan atrás, con la promesa de venir después de terminar el pan.
Ichigo le pregunta si él es un Arrancar y que es lo que quiere con él, afirmando que él no parece querer vengarse de Aizen. Ebern niega ser un Arrancar y muestra, entonces una cruz Quincy de la que genera un arco.
En 64to distrito de Rukongai, Ikkaku y Yumichika encontrar un pueblo vacío. Ikkaku afirma que lo que está sucediendo todavía debe estar en marcha ya que el informe se indica que recibió todavía había algunas personas en la aldea. A los informes de Shinigami que no podía encontrar a nadie, mientras que otro les lleva a una serie de huellas.
Extraños sujetos vienen a declarar la guerra. Mientras tanto, un informe que se está entregando a Yamamoto cuando es interrumpido por un grupo de personas vestidas de blanco cuyos rostros están ocultos.
Ichigo lucha con Ebern, quien de los "cañones" de su arco arroja unas potentes ráfagas de energía, pero para Ichigo no significan mucho problema ya que solo lo esquiva sin problemas. Ebern le dice a Ichigo que utilice su Bankai y luego de meditarlo este finalmente accede. Ebern utiliza un poder muy extraño junto con un conjuro, que atrapan a Ichigo.
Los sujetos provocan a Yamamoto diciendo que conocen la intriga que el posee por averiguar quienes son, pero no se lo dirán a pesar de que es muy fácil adivinar quienes son. Los sujetos se despiden ante un desesperado intento del Capitán Comandante por detenerlos. Pero finalmente el huyen con una extraña sombra parecido a Garganta.
De nuevo en la pelea de Ichigo, Ebern seriamente lastimado pregunta al Shinigami Sustituto porque su bankai no desapareció. Ichigo con su Zanpakuto en el cuello de Ebern pregunta a que se refiere con "desaparecer".
Ebern llega un deteriorado edificio donde también se encuentran los sujetos del Wandenreich que hablaron con Yamamoto. Uno de ellos descubre su rostro y ve a Ebern inclinado ante el dando a entender que el es el líder de la organización. Pero Ebern lo ignora y comienzan a discutir, y entonces el tipo con el que discutía Ebern pierde el brazo y un extraño hombre sentado en un trono, que parece ser el líder de la organización, dice que no le gusta que pelen delante de el.
Ichigo regresa a su casa luego de la batalla con Ebern. En ese momento Yuki recibe un llamado de la Sociedad de Almas en donde le informan que debe volver para el funeral del Teniente de la Primera División Chojiro Sasakibe.
Luego de un rato Ichigo decide patrullar y recuerda lo que Uryu le contó. Que si la Sociedad de Almas informó ese mensaje a Yuki, quién es un shinigami raso, fue solo porque sabían que estaba con Ichigo, lo que supone que en el futuro pedirán su ayuda. Y de repente Nell cae del cielo, sobre Ichigo, utilizando su "super velocidad" y , entre lagrimas, la pide ayuda a este último.
De nuevo con los Wandenreich, el líder le pregunta al tipo que discutia con Ebern, cuyo nombre es Lüdaas Friegen si era profeta; ya que declaró que en cinco días la Sociedad de Almas seria aniquilada por el Wandenreich. El lider exclama que a el solo le interesa el presente y termina asesinando a Luders Friegen.
Luego de esto le pide un informe a Ebern y le dice que puede ser una de las "piedras para construir la paz". Pero luego termina asesinándolo igual que a Luders. El líder declara que si quiere arrancars puede conseguirlos cuando quiera.
Luego se ve a Tier Harribel esclavizada por el Wandenreich y uno de ellos declara que el Hueco Mundo ya es de su territorio. Pesche también llega al Mundo de los Vivos y le explica a Ichigo la crítica situación del Hueco Mundo.
En la Sociedad de Almas, se lleva a cabo el funeral de Teniente Sasakibe, mientras Byakuya explica el historial de Teniente; aclarando que fue capaz de alcanzar el bankai antes que Shunsui Kyoraku y Jushiro Ukitake, y que cumplía todos los requisitos para ser un capitán, pero nunca accedió a dejar su división.
En la casa de Ichigo hay una reunión con relación a lo que esta sucediendo en el Hueco Mundo. Pesche le cuenta a Ichigo que unos extraños soldados raptaron a Dondochakka, y entonces Ichigo decide entrar en el Hueco Mundo para rescatar a Dondochakka, pero Ishida les dice que no puede acompañarlos esta vez. Ichigo dice que ya lo sabía y que solo le pregunto para que no se moleste con el.
En el Hueco Mundo un sujeto del Wandenreich encuentra la medalla que llevaba Ebern y se da cuenta que lo uso, pero no tuvo efecto. Entonces el Líder del Wandenreich dice que tendran que encontrar otra manera de capturar el Bankai de Ichigo. El líder ordena que se da aviso al Iacto Arme del Hueco Mundo, de que capture unos cuantos "idiotas".