La historia se enfoca en Itachi, recordando su lealtad al Clan Uchiha.
El despertar del Mangekyō Sharingan de Itachi fue un evento traumático, desencadenado por la entrega de su ojo izquierdo por parte de Shisui y su posterior suicidio. Este trágico suceso marcó el inicio de su camino oscuro.
Tras el incidente, Itachi se vio envuelto en un conflicto interno y externo. Fue interrogado por la Policía Militar de Konoha y su propio padre, Fugaku, quienes lo sospechaban de la muerte de Shisui. La tensión culminó con su detención por parte de su hermano menor, Sasuke.
Posteriormente, Itachi fue asignado al mando de un cuerpo especial del ANBU, bajo las órdenes directas de Danzō Shimura. Allí, recibió una misión de asesinato y fue emparejado con dos compañeros de equipo. Tras la exitosa culminación de la misión, Danzō le reveló información crucial sobre las actividades de la Policía Militar, aumentando la presión sobre Itachi.
Durante una reunión del clan, Itachi, oculto entre los árboles junto a sus compañeros del ANBU de la Raíz, vigilaba atentamente los movimientos de los Uchiha. Recibió la orden de informar a Danzō de cualquier actividad sospechosa, lo que lo colocaba en una posición de doble lealtad.
En el santuario, Fugaku Uchiha compartió con Itachi la importancia de una antigua inscripción guardada por el clan. A pesar de que Itachi ya había despertado su Mangekyō Sharingan, su padre reveló que ni siquiera con ese poder ocular podía descifrar completamente el contenido de la piedra. Fugaku también habló de la creciente discriminación hacia el Clan Uchiha, del poder para controlar al Kyubi y de la figura de Madara Uchiha.
Fugaku confesó que había ocultado su propio Mangekyō Sharingan para evitar que el clan intentara tomar Konoha por la fuerza, ya que con ese poder se podía controlar al Kyūbi. Para ilustrar el peligro, mostró a Itachi, a través de un genjutsu, un escenario hipotético: la captura del jinchūriki del Kyūbi por parte de los Uchiha y la liberación de la bestia por Fugaku, lo que resultaría en la destrucción de Konoha y, consecuentemente, del propio Clan Uchiha. Esta visión aterrorizó a Itachi.
El padre de Itachi apeló a su ayuda para detener a Konoha y, con su influencia en el ANBU, lograr una revolución. La petición de su padre para que ayudara al clan pesó enormemente sobre Itachi.
Itachi se presentó ante el consejo, el Tercer Hokage y Danzō, informando sobre la revolución planeada por el Clan Uchiha. Danzō insistió en la necesidad de actuar antes que ellos, pero Hiruzen Sarutobi se opuso. Más tarde, a solas con Danzō, Itachi se enfrentó a una decisión imposible: unirse a los Uchiha y morir con ellos, o unirse a Konoha y masacrar a su propio clan a cambio de la salvación de Sasuke. Itachi se convirtió en la única persona capaz de ejecutar esta terrible misión.
En la fatídica noche de la masacre, Itachi, vestido con su traje de ANBU y con su máscara puesta, se dispuso a cumplir su misión frente a la residencia Uchiha. Simultáneamente, un hombre enmascarado comenzó su propio ataque en el cuartel de la Policía Militar de Konoha.
Los Uchiha fueron masacrados uno por uno por Itachi. Posteriormente, se encontró con su padre, Fugaku, quien le pidió que le mostrara los cambios en los resultados tras su anterior revelación con genjutsu. Una vez que el hombre enmascarado eliminó a todos los Uchiha del cuartel de la Policía Militar, decidió retirarse, pero fue atacado por Izumi. Itachi esquivó el ataque, la capturó y la eliminó mientras ella suplicaba por su vida.
Tras la revelación final de Itachi a su padre, Fugaku comprendió la situación y desapareció, revelándose como un clon de sombra. Itachi se dirigió entonces a matar a su padre, limpiándose la sangre de los Uchiha de su rostro.
Al entrar en la residencia Uchiha, Itachi procedió con cautela, notando la ausencia de trampas y resistencia por parte de su padre. Encontró a sus padres, Fugaku y Mikoto, arrodillados y de espaldas a él. Itachi intentó explicarse, pero ellos ya lo entendían. Fugaku le hizo una última promesa: que cuidaría de Sasuke.
Concluida la masacre, Itachi se reunió con el hombre enmascarado, quien preguntó si debían irse. Itachi respondió que primero debía comunicar la noticia a los líderes de Konoha.
Reunido con Hiruzen, el Hokage le preguntó a Itachi qué haría ahora que se había convertido en un desertor. Itachi declaró que se uniría a Akatsuki para estar cerca de "ese hombre".
A las afueras de Konoha, Itachi se encontró con sus compañeros del ANBU, quienes se preparaban para matarlo. En un lugar lejano, el hombre enmascarado, ahora con una nueva máscara, explicó que en la organización se hacía llamar Tobi y que no era un miembro oficial. Itachi preguntó por qué ocultaba su identidad, a lo que Tobi respondió que causaría muchos problemas si se supiera que Madara Uchiha estaba vivo, y que el líder de Akatsuki, a quien iba a conocer, ya conocía su verdadera identidad.
Frente al Gedō Mazō, Itachi se encontró con Orochimaru y notó un cambio en el comportamiento de Tobi. Orochimaru preguntó a Itachi si él era el ninja del "rumor". El líder de Akatsuki, portando una banda ninja rasgada de Amegakure y acompañado por su compañera, explicó que el objetivo de la organización era traer la paz al mundo shinobi, reemplazando a las Cinco Grandes Naciones Shinobi. Para lograrlo, reunirían a los mejores ninjas, sin importar su aldea o historial criminal.
🔥 LA VIDA DE ITACHI UCHIHA: EL HÉROE QUE ELIGIÓ SER VILLANO🩸⚔️
El líder dio la bienvenida a Itachi y le pidió que renegara de Konohagakure. En respuesta, Itachi rasgó su banda ninja y recibió un anillo con el kanji de escarlata.