Tras el regreso a los muros, los miembros de las Tropas de Reconocimiento se enfrentan a una situación cada vez más compleja. Erwin debe ser juzgado por las numerosas bajas causadas en sus operaciones, mientras Hange asume el liderazgo de la legión. Un obstáculo inesperado surge con el asesinato del pastor Nick, quien poseía información crucial sobre la presencia de titanes colosales dentro de la muralla, lo que confirma que los enemigos no solo acechan fuera, sino también dentro de los muros.
Los soldados de la legión deben lidiar con antiguos aliados y la amenaza de traiciones, mientras continúan con el plan de sellar la Muralla María. Las respuestas al asesinato de Nick apuntan a un escuadrón interno de la Policía Militar, que persigue a Eren.
El nuevo escuadrón de Levi recibe órdenes de Erwin, lo que obliga al grupo a moverse y evadir a sus perseguidores. El comerciante Dimo Reeves se une a la causa, habiendo intentado previamente secuestrar a Eren e Historia, sin saber que eran Jean y Armin disfrazados. Levi, Mikasa, Connie y Sasha los encuentran, descubriendo que Reeves y sus hombres actuaban bajo las órdenes de la Policía Militar. Secuestran a dos miembros de la Policía Militar, Djel Sanes y Ralp. Hange y Levi torturan a Djel Sanes para obtener información, pero la aparición de Kenny Ackerman y sus hombres complica la situación. Tras una espectacular persecución, logran capturar a Eren e Historia y matar a Dimo Reeves, incriminando a las Tropas de Reconocimiento.
El escuadrón de Levi sigue el rastro de los secuestradores para rescatar a Eren, quien está en manos de Rod Reiss, el verdadero líder de la monarquía y padre de Historia. Kenny Ackerman resulta ser un miembro de la Policía Militar Central y capitán del Escuadrón de Control Antipersonas, conocido por sus asesinatos pasados.
Kenny, al preguntar a su abuelo moribundo sobre la lealtad del clan Ackerman al rey, descubre que eran temidos por su incontrolabilidad. El anciano explica que la mayoría de la población compartía una línea de sangre, mientras que los clanes Ackerman y asiáticos eran un obstáculo para el ideal del rey de eliminar los recuerdos de la humanidad antes de la era de las Murallas para alcanzar la paz. La familia real poseía el poder de los titanes para crear las murallas y borrar recuerdos, pero debían silenciar a los clanes restantes. Los Ackerman, inmunes a la manipulación de memoria y poseedores del "poder despertado", solo lo activan al proteger a alguien y recibir una orden cercana a la muerte de ese individuo.
Eren e Historia son llevados a la capilla de los Reiss. Eren experimenta recuerdos de un desconocido transformándose en titán y enfrentándose a una mujer titán, masacrando a la familia Reiss. También revive el momento en que su padre le inyectó un suero, transformándolo en titán y devorándolo. Historia, al tocar a Eren, recuerda a Frieda Reiss, su medio hermana, quien borró sus recuerdos para protegerla. Rod Reiss revela que Grisha Jaeger asesinó a Frieda y devoró su poder para obtener la Coordenada, instando a Historia a hacer lo mismo para recuperar el poder perdido.
Historia se niega a convertirse en un monstruo y devorar a un amigo. Rod Reiss decide transformarse en un titán descomunal. Eren, temiendo no ser lo suficientemente poderoso, bebe un líquido de un frasco con la etiqueta "Acorazado Braun" antes de transformarse. Al despertar, Eren descubre que pudo endurecer su forma de titán y sostener una estructura que colapsaba, aunque no recuerda cómo lo hizo. Rod Reiss, ahora un titán de 120 metros, se dirige hacia el Distrito Orvud.
Eren está dispuesto a sacrificarse nuevamente, pero Historia explica que la familia Reiss intentó sin éxito deshacer el lavado de cerebro y que Grisha robó la Coordenada para romper este control. Eren recuerda las últimas palabras de Grisha sobre usar el poder para proteger a sus compañeros. En el Distrito Orvud, Erwin utiliza a los civiles como señuelo para atraer a Rod. Tras intensos cañonazos, Rod se apoya en la muralla. Eren se transforma y, tras inutilizar las manos de Rod, arroja explosivos a su boca, destruyendo al titán. Historia lo remata cortando la parte principal.
Horas después, Levi encuentra a Kenny Ackerman moribundo. Dos meses después del ascenso de Historia al trono, las Tropas de Reconocimiento inician la misión para recuperar la Muralla María en el Distrito Shiganshina. Logran sellar los agujeros de la muralla, pero Reiner Braun es descubierto y se transforma en titán. Eren también se transforma, y ambos combaten. El Titán Bestia aparece, bloqueando rutas de escape e iniciando un ataque. El Titán Bestia lanza un barril con Bertholdt hacia Reiner. Levi derrota al Titán Bestia gracias a un plan suicida de Erwin, que resulta en la muerte de los soldados restantes y del propio comandante. El titán cuadrúpedo se lleva al usuario del Titán Bestia.
Bertholdt es vencido por Eren con la ayuda del sacrificio de Armin, quien sufre quemaduras. El usuario del Titán Bestia aparece, reconociendo al padre de Eren y rogándole que le crea. Reiner cae nuevamente. Hange descubre que el estuche que Reiner intentaba alcanzar contenía una carta de Ymir para Christa. Jean interviene para evitar que Hange mate a Reiner, recordando que su poder podría ser robado.
Eren pide a Levi el suero para salvar a Armin, pero llega Erwin gravemente herido. Levi decide usar el suero en Erwin, pero Eren se opone. Levi golpea a Eren y se queda a solas con los cuerpos. Al intentar inyectar el suero a Erwin, este lo aparta inconscientemente, recordando su infancia. Levi comprende que Erwin, convertido en un demonio y esclavo de su sueño, solo encontrará la liberación en la muerte. Armin, inyectado con el suero, se convierte en el nuevo Titán Colosal tras devorar a Bertholdt.
Eren, Mikasa, Hange y Levi llegan al sótano de la casa de los Jaeger, descubriendo el pasado de Grisha y el origen de los titanes. Al regresar a la Muralla Rose, Eren y Mikasa son encarcelados por enfrentarse a Levi. En prisión, Eren y Armin comparan la información de los libros de Grisha con los recuerdos de Eren. Los diez supervivientes de la misión a Shiganshina se reúnen con la Reina Historia para discutir los resultados y la información sobre el mundo exterior. Eren reflexiona sobre su incapacidad para usar la Coordenada contra Dina, concluyendo que solo funciona con miembros de la realeza transformados en titanes, pero decide no revelar esto para proteger a Historia.
Un año después, las Tropas de Reconocimiento realizan una expedición al exterior de la Muralla María, encontrando un titán que indica la cercanía de Marley. La legión llega a la frontera y al océano, cumpliendo el sueño de Armin.
💥Armin Arlert: VIVIR por un Sueño | Análisis e Historia Completa (Attack on Titan)
La operación de reconquista de la Muralla María se ve interrumpida por la aparición de los Titanes Acorazado y Bestia. Erwin ordena a Eren que descienda a Shiganshina y se transforme para combatir a Reiner, utilizando sus poderes de endurecimiento para romper su coraza. El Cuerpo de Exploración supera al Titán Acorazado gracias a las lanzas...