La vida de Itachi Uchiha, marcada por el sacrificio y el misterio, dejó una huella imborrable en el mundo ninja, especialmente en Naruto Uzumaki. A pesar de las sombras que envolvieron sus acciones, Itachi demostró ser un protector leal de Konoha, orquestando eventos que, aunque dolorosos, allanaron el camino para un futuro más seguro.
La trama de la "Misión de Persecución de Itachi" (イタチ追跡任務, Itachi Tsuiseki Ninmu), también conocida en el anime como "La promesa del maestro y la venganza" (師の予言と復讐, Shi no Yogen to Fukushū), se desarrolla en la Segunda Parte de la serie, abarcando desde el Capítulo 343 hasta el 367 del manga y los Episodios 113-118 y 121-126 del anime. Este arco narra los intentos de Sasuke y Naruto por encontrar a Itachi Uchiha, un encuentro cargado de tensiones y revelaciones.
El clan Uchiha, en su búsqueda por entender las acciones de Itachi, se enfrenta a él. Tres miembros del clan le informan sobre la ausencia de Shisui Uchiha y cuestionan la especial consideración hacia Itachi por su tiempo en ANBU. Itachi, prometiendo mayor cautela, se ve confrontado con la noticia del suicidio de Shisui. La investigación del clan, que examina la nota de suicidio, duda de los motivos de Shisui, considerando la facilidad con la que el Sharingan puede copiar caligrafías. Itachi, con sabiduría, les recuerda que no se debe juzgar por apariencias o convicciones.
La desconfianza hacia Itachi se hace palpable, y él, reconociendo las sospechas, les desafía a ser directos. La amenaza de castigo por traición al clan se cierne sobre él, pero Itachi responde con contundencia, golpeando a los tres ninjas y reiterando la falacia de juzgar por las apariencias. Les reprocha su subestimación de su paciencia y la profundidad de su amabilidad, señalando que el clan ha fallado al no comprender su verdadera fuerza.
Uno de los Uchiha revela que Shisui tenía la misión de vigilar a Itachi, cuyas acciones y discurso se habían vuelto extraños tras su ingreso a ANBU. Ante la pregunta sobre sus pensamientos, Itachi declara que aferrarse al clan limita su capacidad y merece ser eliminado, calificando de estúpido el temor a lo desconocido.
Fugaku Uchiha interviene para detener la confrontación, cuestionando la ausencia de Itachi la noche anterior. Itachi, con una metáfora sobre "tocar las alturas", arroja un kunai contra el símbolo del clan, expresando su desesperanza por la incapacidad del clan de lograr un cambio real atado por leyes y limitaciones. Cuando el arresto de Itachi parece inminente, Sasuke intercede, pidiendo que se detengan. Itachi se disculpa por su actitud, y Fugaku, asumiendo la responsabilidad, evita el arresto oficial, recordando que no se puede proceder sin una orden de ANBU.
Mientras tanto, en las guaridas de Orochimaru, el Sannin y Kabuto discuten el potencial de Sasuke, recordando su miedo inicial y su temprana maestría del Sharingan. Orochimaru, impresionado, le otorgó el Sello Maldito, esperando que Sasuke buscara su poder. Kabuto, por su parte, se prepara para la Reencarnación del Cadáver Vivo, mientras Sasuke perfecciona su Chidori Nagashi y entrena su puntería con shurikens, añadiendo la destrucción de objetivos con su técnica.
En Konoha, Tsunade es informada sobre la pérdida de comunicación con los ANBU que custodiaban al Tres Colas, lo que requiere el envío de nuevos ninjas para investigar. El cuerpo de Orochimaru se debilita, impulsando a Kabuto a buscar medicina potente, mientras anhela el poder que obtendrá al poseer el cuerpo de Sasuke.
El enfrentamiento entre Sasuke y Orochimaru culmina con la derrota del Sannin. Sasuke, liberando el segundo nivel del Sello Maldito, se proclama el cazador de la serpiente. Orochimaru, recordando su pasado y la simbología de la piel de serpiente blanca, reflexiona sobre la inmortalidad y la posibilidad de revivir a los muertos, un concepto que lo llevó a sus experimentos y a huir de Konoha.
Sasuke, al hacer suya la Reencarnación del Cadáver Vivo, demuestra su dominio. Anko, sintiendo el Sello Maldito, sospecha de un evento significativo, mientras Naruto, Tsunade y Jiraiya presienten un cambio inminente. Itachi, al ver un halcón, también percibe la alteración en el flujo de eventos.
Sasuke, liberando a Suigetsu, le pide que se una a él en su búsqueda, a cambio de ayuda para encontrar la Kubikiribōchō de Zabuza. Su búsqueda los lleva a la tumba de Zabuza, y posteriormente a la casa de Tazuna, donde obtienen información sobre el paradero de la espada. Tras un enfrentamiento con Tenzen Daikoku, Suigetsu recupera la espada, demostrando su habilidad con el Jutsu de Hidratación.
El segundo miembro del equipo de Sasuke es Karin, una mujer que, a pesar de la muerte de Orochimaru, mantenía a los prisioneros en la Guarida del Sur. Sasuke, junto a Suigetsu, la convence para que se una a ellos, liberando a los prisioneros y esparciendo el rumor de que Sasuke traerá estabilidad al mundo. Karin, influenciada por su rescate anterior a manos de Sasuke, acepta unirse al equipo, que se prepara para partir. El nuevo equipo, llamado "Hebi", se forma con el objetivo de matar a Itachi Uchiha.
El Equipo Hebi se enfrenta a desafíos, incluyendo la captura de prisioneros portadores del Sello Maldito en la Guardia del Norte, un lugar de experimentos horribles. Sasuke prohíbe matar a los atacantes mientras se dirigen a la celda de Jugo, un individuo con impulsos homicidas. Jugo, tras recordar a Kimimaro y su sacrificio por Sasuke, acepta unirse a Hebi, creyendo que Sasuke es la reencarnación de Kimimaro.
Itachi y Kisame son convocados por Pain tras la muerte de Orochimaru, y se les advierte sobre los movimientos de Sasuke. Mientras tanto, el equipo de Konoha se moviliza para buscar a Sasuke, utilizando perros ninja para mantener la comunicación. El equipo Hebi se dispersa para recabar información sobre Akatsuki. Sasuke se enfrenta a Deidara, utilizando serpientes blancas para protegerse de sus ataques de arcilla. Deidara, en un acto final, se suicida en una explosión masiva, pero Sasuke sobrevive gracias a su habilidad para repeler los ataques con su espada y el Chidori.
Tras la explosión, Tobi, que también sobrevivió, se encuentra con Pain, proclamándose Uchiha Madara y destacando el poder del Sharingan de Sasuke. El equipo de Konoha persigue a Sasuke, pero Karin detecta su presencia, obligándolos a huir. Naruto, utilizando clones, se encuentra con Itachi, quien le revela su intención de hablar con él.
En Konoha, Jiraiya informa a Tsunade sobre el escondite del líder de Akatsuki. Se revela que el Cuarto Hokage es el padre de Naruto. En un encuentro crucial, Itachi pregunta a Naruto qué haría si Sasuke atacara el pueblo. Satisfecho con la respuesta de Naruto de proteger Konoha sin matar a Sasuke, Itachi le otorga parte de su poder, esperando que no tenga que usarlo. Itachi confía en Naruto la preservación de este poder, creyendo que es el único capaz de hacerlo, dada su cercanía a su hermano.