La profunda conexión y el conflicto entre los hermanos Uchiha, Sasuke e Itachi, es uno de los pilares de la narrativa de Naruto. Sus encuentros, cargados de dolor y malentendidos, definen el camino de ambos ninjas y el destino de Konoha.
El Encuentro en el Bosque y las Preguntas Pendientes
Sasuke se encuentra con Itachi en el bosque, recordando su último enfrentamiento. Decide seguirlo para hablar y le pide que espere, pero Itachi, absorto en sus propios asuntos, no lo escucha. Lleno de frustración, Sasuke activa su Susanoo para intentar retener a su hermano, pero Itachi lo bloquea con el suyo, confirmando su identidad. Sasuke, con la urgencia de la verdad, pregunta a Itachi por qué está allí. Itachi explica que se debe al Edo Tensei de Kabuto y que tiene asuntos importantes que atender, imposibilitando una conversación prolongada en ese momento. Sasuke, sin embargo, insiste en que hay muchas cosas que necesita preguntarle, afirmando que ahora comprende todo sobre él, lo cual ha sido el catalizador de su decisión de destruir Konoha.

Itachi le recuerda a Sasuke que las personas viven según sus propias convicciones. Sin embargo, Sasuke replica que ya no vive en una ilusión, ya que ahora posee sus propios ojos, refiriéndose a la obtención del Mangekyo Sharingan. Itachi, recordando su conversación con Naruto, le comenta a Sasuke lo que ha oído sobre sus acciones recientes. Sasuke, firme, afirma que fue él quien lo cambió. Recordando las palabras de Tobi, Sasuke pregunta por qué fue el único en sobrevivir a la masacre de su clan. Itachi responde que en ese momento no sabía nada de lo que estaba sucediendo y que pensó que algún día sería juzgado por sus crímenes por otro Uchiha como él. Por eso, usó el odio que sentía y, en consecuencia, falló. Deseaba que Sasuke tomara el camino correcto, pero desde el momento de su muerte, lo había empujado hacia un sendero sin salida.
Sasuke le reclama que no quería caminar por ese camino sin conocer la verdad, y que ahora puede ver a través de los engaños. Itachi ríe y le dice que no solo las indicaciones lo guían por el camino que sigue. Itachi le recuerda que aún tiene cosas importantes que hacer: detener el Edo Tensei.
La Batalla de los Kages contra Madara
Mientras tanto, la guerra se intensifica. Madara duda de la capacidad de Tsunade para vencerlo basándose únicamente en la "Voluntad de Fuego", argumentando que el poder no tiene relación con la voluntad. Tsunade discrepa, afirmando que una persona se fortalece al heredar la voluntad de otro. Como ejemplo, menciona la revolución que provocó con el Ninjutsu Médico, la creación de un sistema completo y el establecimiento de tres reglas para los Ninjas Médicos, las cuales enumera mientras libera su sello. Revela una cuarta regla, accesible solo para aquellos que han adquirido el Jutsu: Fuerza de un Centenar.

Los otros Kages se sorprenden al escuchar el nombre de esta técnica, y Madara admite no haber oído hablar de ella. Tsunade explica que es un Kinjutsu que solo ella puede utilizar. Madara, confiado, afirma que liberarse del polen no les ayudará a derrotarlo. Tsunade, decidida, declara que esta vez atacarán todos juntos. Tsunade se lanza hacia él, preparándose para un golpe devastador, pero Madara se protege con la caja torácica de su Susanoo, reconociendo su fuerza. Acto seguido, utiliza la técnica Elemento Fuego: Gran Aniquilación de Fuego para intentar acabar con Tsunade. Sin embargo, Mei responde con técnicas acuáticas, neutralizando el jutsu de Madara y contraatacando. Ōnoki y A atacan por la espalda, y Tsunade le asesta una fuerte patada, lanzándolo lejos.
Madara comenta que si les hubiera parecido tan débil, les habría enseñado a levantarse de entre los muertos, refiriéndose a Hashirama. Afirma que lo único que queda de Hashirama es su poder aferrándose a él, y que su hermano no solo le dejó sus ojos y su poder, sino también odio, y que lo único que él puede dejarles es odio.

Paralelamente, Dan y Choza Akimichi discuten los eventos de la guerra, comentando el resucitado Madara y su enfrentamiento contra los Kages, incluida Tsunade. Dan se sorprende de que Tsunade sea Hokage, pero Choza le advierte que no deben subestimar a Madara, ya que solo Hashirama Senju podría derrotarlo.
De vuelta en la batalla, Tsunade logra asestar un golpe contundente a Madara, destrozando un lado de su cuerpo. Sin embargo, al ver que se regenera, Gaara se une a la batalla y lo sella. Madara revela que era un clon de madera y atraviesa a Tsunade con una espada del Susanoo. Madara emerge de una raíz, afirmando que solo él podía ver a través de esa técnica de Hashirama.
Las tres batallas cruciales para salvar el mundo están en curso. En este momento, aparece la silueta de un cuervo tendido en el exterior. Itachi y Sasuke llegan hasta Kabuto. Sasuke confunde a Kabuto con Orochimaru, pero luego lo reconoce por su voz. Itachi le dice que va a detener su Edo Tensei.
La batalla entre Madara Uchiha y los cinco Kages continúa. Tsunade se libera del Susanoo y, gracias a su Jutsu de Regeneración Mitótica, regenera su cuerpo sin necesidad de sellos de manos. Madara reconoce esta habilidad como la misma que poseía Hashirama. Ōnoki utiliza su Jinton para atacar a Madara, pero este lo absorbe con el poder del Rinnegan. Madara le explica que ese poder no funciona con él, y que cuando ese jutsu lo tocó antes, fue porque él quiso mostrarles el rostro de Hashirama para desalentarlos.
Tsunade le menciona a Madara que está acorralado y por eso usó el Clon de Madera para evitar ser sellado. Este responde que son cinco contra uno, el número perfecto para divertirse. Entonces, utiliza el Elemento Madera: Múltiples Clones de Madera, creando cinco Madaras para cada Kage.
El Enfrentamiento con Kabuto y la Verdad Detrás de la Venganza
El capítulo comienza mostrando a Itachi y Sasuke frente a Kabuto, quien, para evitar el genjutsu de los hermanos Uchiha, cubre su rostro con su capa. Kabuto libera numerosas serpientes, que parecen haber aumentado de tamaño. Utiliza el jutsu Arte Sabio: Jutsu Blanco Violento, una técnica que afecta los sentidos del adversario y entumece el cuerpo. Kabuto emplea la córnea de una serpiente para ver a pesar de la activación del jutsu y, con su habilidad acuática, evade sus efectos. Luego, se dirige hacia los hermanos con la intención de capturar a Sasuke y, posteriormente, recuperar el control sobre Itachi. Sin embargo, Itachi anticipa su plan y protege a Sasuke con su Susanoo.

Kabuto pregunta a Itachi si puede percibirlo, pero Itachi responde que solo fue porque sabía lo que intentaría hacer. Sasuke utiliza su Chidori para atravesar a Kabuto, pero este da un gran salto y se coloca en el techo, sujetándose con su cola de serpiente. Itachi le dice a Sasuke que recuerde cuando intentaron atrapar a Inoshishi, y Sasuke usa su flecha del Susanoo para atravesar la cola de Kabuto, fijándolo contra el techo. Kabuto alarga su cola e intenta coger la espada de Sasuke. Sasuke, creyendo que se cortará la cola, se lo dice a Itachi, pero Kabuto pretendía usarla contra Itachi. Itachi usa Genjutsu en Kabuto para confundirlo y golpearlo, pero Kabuto lo esquiva, solo logrando rebanarle un cuerno.
Kabuto intenta persuadir a Sasuke, mostrándole ilusiones de una hermandad y recordándole los problemas que causó en Konoha, la traición a sus camaradas y lo que podría lograr si se uniera a él. Entonces, Sasuke recuerda una ocasión en la que, encubierto con Tobi, escucharon la conversación de dos ninjas de Konoha que hablaban de su hermano como un criminal de Clase S. Enfurecido, Tobi le pide que se calme.
¿Quién Soy? La Historia de Kabuto
Kabuto recuerda los días que pasó en el orfanato, ayudando a sanar a los shinobis durante las batallas para conseguir fondos para el orfanato. Un día, aparece Danzō con dos miembros de la Raíz, Orochimaru y un miembro desconocido. Le ofrecen a la Guardiana del Orfanato, Nonō, realizar una misión de espionaje: infiltrarse en Iwagakure y descubrir si planeaban un ataque contra Konoha. Ella se niega inicialmente, pero Danzō menciona que es la única capaz de realizar la misión, ya que nadie en la Raíz se le compara en inteligencia y que no vendería a Konoha tan fácilmente. Ella acepta, ya que Danzō y sus ANBU insinúan lo fácil que sería robar el dinero del orfanato o secuestrar a un niño. Sin embargo, como resultado de obtener esta información, un hombre perdió la vida, por lo que deciden llevarse a un niño con ellos.
Kabuto, que escuchó toda la conversación, decide irse con ellos por razones desconocidas. Kabuto vive durante un tiempo en Kumogakure, Kirigakure, Sunagakure e Iwagakure como espía. Mientras está en Iwagakure, es rodeado por ninjas enemigos y piensa en el orfanato y en cómo desea volver a verlos. Un ninja lo descubre, pero Kabuto logra vencerlo y descubre que era su madre. A Nonō le habían borrado la memoria y ahora era una Kunoichi de Iwagakure.
El capítulo continúa con Orochimaru diciéndole a Kabuto que sabe por qué Nonou lo atacó y no lo recuerda, y le pregunta si quiere saberlo. Luego, se ve a Orochimaru y Kabuto en un laboratorio en una isla. Orochimaru le dice que nadie ha estado antes allí y que es la primera persona en verlo. A continuación, Orochimaru explica que la Raíz estuvo lavándole el cerebro lentamente a su madre para que creyera que mataba a Kabuto sin saberlo. Kabuto le pregunta si es el encargado de eliminarlo, y entonces usa su Bisturí de Chakra, provocándole un corte profundo a Orochimaru. Cuando intenta otro corte, se aleja inmediatamente porque Orochimaru muda de piel y se pone de pie sin ninguna herida.
Orochimaru le dice que sería una pena desperdiciar sus habilidades matándolo y le explica que intenta conseguir más conocimientos y nuevas habilidades. Además, le explica que quiere fundar una nueva villa, la Aldea Oculta del Sonido, y le promete que lo protegerá de Danzō, siendo su superior, padre y hermano.
Kabuto termina su historia y les dice a los Uchiha que ese es el motivo por el que se ha estado añadiendo cosas a sí mismo. No quiere un sermón, sino sus habilidades e información. Kabuto les dice que son del famoso Clan Uchiha de Konoha y que poseen el Sharingan y muchas técnicas. Kabuto se propone a recuperar el control sobre Itachi, pero este le dice que ya ha fallado, que el nombre Uchiha solo denota las raíces de dónde uno pertenece.
Sasuke le pregunta a Itachi si de verdad tiene que dejarlo con vida. Itachi le dice que solo necesita tiempo para usar el Izanami. Kabuto entonces utiliza la técnica del Ataque del Par de Espíritu Malignos, y de su cuerpo aparece el torso de Sakon. Luego, cambia al de Jirōbō y usa el Elemento Tierra: Retorno a la Costa de Tierra para levantar una pared de piedra e interrumpir el Amaterasu que protegía a los hermanos. Después de esto, cambia a Kidōmaru y usa Telaraña Desenrollar, que Sasuke e Itachi destruyen con Amaterasu. Kabuto los sorprende con la Danza del Helecho de Kimimaro, pero Itachi lo destruye con el Susanoo. Kabuto crea una flauta de hueso y cambia el torso de Kimimaro por el de Tayuya. Sasuke e Itachi quedan atrapados en la ilusión de la Flauta Demoniaca: Cadenas de Fantasía.
¡A Las Nueve...! El Desentrañar del Izanami
El capítulo comienza con Itachi explicando las bases del Izanami y desentrañando sus secretos. Itachi le cuenta a Sasuke que la técnica fue desarrollada a partir del Izanagi y para usarla contra los Uchiha que se hubieran vuelto arrogantes por el uso del Izanagi. Además, explica que hay una forma de salir del bucle infinito. Después de su explicación, dice una vez más que Kabuto le recuerda mucho a él mismo y que ha cometido los mismos errores que él.
La Venganza de Sasuke: El Combate contra Itachi
La Batalla Predestinada entre Hermanos (連命の兄弟対決, Unmei no Kyōdai Taiketsu), conocida como "La promesa del maestro y la venganza" (師の予言と復讐, Shi no Yogen to Fukushū), es el octavo arco de la Segunda Parte de la Serie, que abarca desde el Capítulo 384 hasta el Capítulo 412 y desde el Episodio 134 hasta el Episodio 143. Trata sobre la batalla entre los hermanos Sasuke e Itachi.
Sasuke llega a la guarida de Akatsuki, donde se encuentra Itachi entre las sombras. Itachi le dice a su hermano que ha crecido; Sasuke responde que Akatsuki conserva sus ojos despiadados. Itachi pregunta si no va a cargar contra él como la última vez, pero Sasuke se coloca rápidamente tras su hermano mayor y lo atraviesa con su Chidori Eisō, levantándolo del suelo y respondiendo que ni siquiera Itachi sabe de qué es capaz ahora, formando desde su técnica otras lanzas que salen a través del cuerpo del Akatsuki.

Los demás miembros de Hebi llegan junto a su líder preocupados al haber sentido otro chakra en la cueva, pero Sasuke, sin explicarles nada, les dice que le sigan. En el bosque, Karin siente muchas personas con el mismo chakra rodeándolos, pero Sasuke ordena seguir de frente, por lo que se encuentran con un Clon de Naruto, al cual derrota con un Chidori. Hebi continúa su camino hasta que Kisame aparece ante ellos, pidiendo a Sasuke que continúe solo mientras él y los demás esperan, lo que el Uchiha acepta. A pesar de que Karin no está de acuerdo con esto, acaba resignándose; ante esto, Suigetsu propone al Akatsuki pelear. Kisame, que no había reconocido al hermano de Mangetsu Hōzuki, acepta encantado. Mientras tanto, Tobi se encuentra a propósito con el Escuadrón de Ocho Hombres. Kakashi dice que no se encuentra en los informes de Kabuto; el Akatsuki se presenta como un nuevo miembro de la organización. Kiba le dice que no se pavonee, pero Kakashi les manda estar atentos al enemigo que superan en número, haciendo pensar a Tobi que le subestiman. Sakura se lamenta de que siempre que se acercan a Sasuke aparece un bicho raro que se interpone.
Sasuke e Itachi comienzan su combate. Ya en la Guarida, Itachi pregunta a su hermano qué ve con su Sharingan, a lo que Sasuke responde que puede ver la muerte de su hermano mayor. Tobi consigue repeler todos los ataques de Naruto, lanzándole de una patada a una charca; ante la preocupación de Hinata, Sakura afirma que hace falta más para detener a su compañero e insiste a la Hyūga que mantenga sus ojos en el enemigo. Yamato se sorprende de que el Akatsuki sea capaz de prever los ataques de Naruto, y Kakashi se extraña de que parezca que juega con ellos. El Genin sale del agua y los Chunin muestran sus ganas de pelear, por lo que Yamato manda usar una formación.
Sasuke Asesina a Itachi
Tras un intercambio de golpes, Itachi consigue lanzar a Sasuke rodando por el suelo, lo que este aprovecha para usar el Chidori Nagashi; el Akatsuki salta para esquivar la técnica, pero Sasuke, que había previsto sus movimientos, salta hacia él atravesándolo con su Chokutō y cayendo al suelo. Sasuke acuchilla a Itachi a través del asiento.
Sasuke se enfada y, mientras su hermano le dice que puede preguntar lo que quiera, aparece tras el asiento y atraviesa la piedra y al Akatsuki; mientras que el Sasuke que había asesinado al Clon se deshace en serpientes, siendo una ilusión. El hermano menor pregunta quién es el tercer Uchiha superviviente que Itachi comentó, ya que desea asesinarlo tras acabar con él, porque seguramente ayudó a Itachi a asesinar al Clan Uchiha. El hermano mayor responde que es Madara Uchiha, uno de los fundadores de Konoha y la primera persona en despertar el Mangekyo Sharingan, algo que Sasuke no cree, pero Itachi explica que la realidad es lo que uno cree verdadero y correcto, y a él no le importa que lo crean o no, como creía su hermano que él era amable y cariñoso.
Sasuke recuerda lo que ha pasado con su hermano y lanza un Chidori Eisō a su espalda, llegando al auténtico asiento, deshaciendo la ilusión de su hermano mayor y amenazándolo. Itachi dice que sus palabras le son familiares pero que esta vez parecen ciertas, así que Sasuke le pide que deje de jugar.

Itachi dice a su hermano que, a pesar de su confianza, no ha conseguido los mismos ojos que él, que el Mangekyo Sharingan provoca la pérdida de vista desde el momento en que se despierta. Entonces, pasa a mostrar a su hermano mediante su Mangekyo la historia de Madara Uchiha, que junto a Izuna Uchiha despertaron el siguiente nivel del Sharingan, llegando a convertirse en los líderes del Clan, pero debido al efecto secundario del Mangekyo, Madara comenzó a quedarse ciego, lo que le llevó finalmente a arrancarle los ojos a su hermano e implantárselos, despertando el Mangekyo Sharingan Eterno; con el cual controló a muchos clanes y le llevó finalmente a hacer una alianza con el Clan Senju del Bosque, formando Konohagakure; pero en contra de la política que tenía la aldea, peleó contra el Primer Hokage, donde fue derrotado, pero que aún continúa con vida y con sus ojos. Además, desvela que Madara fue el que provocó el ataque del Nueve Colas a Konoha y fundó Akatsuki.

El hermano menor, deshaciendo el Genjutsu del Akatsuki, se libera de la venda de su cabeza, de sus brazos y de la capa de viaje, y dice que, a pesar de no tener el Mangekyo Sharingan, derrotará a su hermano gracias a su odio, el cual transformará la ilusión en realidad, en otras palabras, la muerte de Itachi. Sasuke invoca, mediante unos sellos que tenía en sus brazos, Shuriken que lanza contra su hermano, que responde con otros Shuriken. Tras varios intercambios de armas, el hermano menor se lanza contra el mayor, que lo detiene, entonces aparece un Clon del Akatsuki, formado durante la pelea, que lanza más Shuriken a un Sasuke inmovilizado, pero del Sello Maldito de este surge una serpiente que lo envuelve, obligando a Itachi a retroceder.
Sasuke atraviesa un Clon de Itachi liberando sus serpientes. De las aves surge Itachi que lanza a su hermano menor contra la pared y lo inmoviliza; pidiendo perdón, coloca sus dedos sobre el ojo izquierdo de Sasuke y se lo extrae, pero cuando se prepara para coger el otro, el hermano menor libera el primer nivel de su Sello Maldito y saca el ala de su transformación, alejando a Itachi, el cual guarda el Sharingan en un tarro con un líquido de conservación. A la espalda de Sasuke surge un Clon de Itachi, que lo vuelve a inmovilizar, permitiendo al verdadero acercarse a por su otra recompensa; pero el hermano menor desata el segundo nivel del Sello Maldito, deshaciendo el Tsukuyomi del Akatsuki.
Zetsu cree que Itachi ganó al haber encerrado a su hermano en una ilusión durante el intercambio de Shuriken, pero el hermano mayor cae de rodillas, impresionado de que su hermano deshiciera el Tsukuyomi.
Sasuke Ataca a Itachi Tras Engañarlo
El Akatsuki cierra su ojo derecho y comienza a formar sellos, pero Sasuke responde invocando un Fūma Shuriken y lanzándolo mientras usa el Jutsu Clones de Shuriken, duplicando el arma, pero Itachi lo esquiva de manera forzada; ante esto, el hermano menor tira de los alambres que había añadido a los Shuriken, consiguiendo herir al Akatsuki en una pierna, lo que asombra a Zetsu, que creía a su compañero capaz de esquivar ese ataque, pero Itachi se encuentra cansado y medio ciego tras el uso del Tsukuyomi.

Itachi consigue esquivar la acometida rompiendo el techo y saliendo al exterior de la Guarida mientras lanza una Gran Bola de Fuego, inútilmente ya que Sasuke se defiende con el ala de su Sello Maldito. Entonces, ambos hermanos chocan sus jutsus de Elemento Fuego, cogiendo el menor la ventaja, pero el Akatsuki usa Amaterasu consumiendo el fuego cruzado y comienza a perseguir a su hermano con las llamas negras, que finalmente le queman el ala, pero este usa a tiempo una técnica de sustitución y abre un boquete en el techo para escapar.

Zetsu, que también se encontraba cerca del alcance de la técnica, se aleja y comprueba que ambos hermanos están casi sin chakra. Sasuke afirma que usará una última técnica con la que convertirá la ilusión en realidad. Comienza a llover y a caer rayos, con lo que Zetsu comprende que el hermano menor lo preparó todo con esos Dragones de Fuego para crear nubes de tormenta. Sasuke sube hasta la parte más alta de la Guarida y explica que va a dirigir los rayos de la tormenta hacia su hermano mayor, una técnica a la que ha llamado Kirin, y con las palabras “Desaparece con el trueno” lanza su jutsu destruyendo parte de la Guarida.

Entonces, dentro de Sasuke, comienza a hablarle Orochimaru, ofreciéndole su poder y la oportunidad de cumplir su venganza, y aunque el Uchiha se resistía, acaba surgiendo de su Sello Maldito el Jutsu de la Serpiente de Ocho Cabezas.
El Final de Itachi
El Uchiha pregunta a su hermano pequeño si tiene algo más que ofrecer, y si no es así, que ha llegado el final. El Akatsuki se dispone a ir a por Sasuke, pero comienza a toser sangre, y el Susanoo se deshace parcialmente, lo que el hermano menor aprovecha para lanzar un Kunai con Sellos Explosivos, pero son detenidos por el Espejo de Yata. Itachi comienza a acercarse a su hermano, el cual se aleja, invocando más Kunai Explosivos y lanzándolos, pero son nuevamente detenidos.
Sasuke cae junto al cadáver de Itachi. Sasuke se queda acorralado contra una pared, Itachi se acerca hasta él y, tras susurrar unas palabras, golpea la frente de su hermano pequeño, recorriendo su rostro con la sangre de su mano para finalmente caer inerte al suelo. El Amaterasu sigue ardiendo en el bosque, Sasuke permanece paralizado, Zetsu no comprende cómo Itachi puede estar muerto.
Comienza a llover, y el Akatsuki que observaba la pelea la analiza, pensando que algo debía ocurrirle a su compañero, ya que no esquivó golpes que podía haber evitado y había estado tosiendo sangre.

Naruto, Kiba y Yamato atacan al unísono, pero el Akatsuki consigue evitar todas sus combinaciones. Hinata afirma que no hay ninguna técnica externa que interfiera. Entonces, Kakashi pide a Shino que use sus técnicas especiales del Clan Aburame, lo que alegra a Shino al no dejarlo de lado como en la antigua misión de rescatar a Sasuke. Los insectos rodean a Tobi, impidiendo que pueda esquivar los ataques, así Shino usa la Esfera de Insectos atrapando al Akatsuki. Hinata confirma que este permanece dentro de la técnica, y Yamato intenta atraparlo con su Elemento Madera; pero de repente, Tobi desaparece, y suponen que mediante un Ninjutsu de Espacio-Tiempo más avanzado que el del Cuarto Hokage. Hinata vuelve a encontrar a Tobi unos metros más lejos de donde desapareció. De repente, al lado del Akatsuki aparece Zetsu, sorprendiendo a los Ninjas de Konoha, pero Yamato lo reconoce del informe que les dio Kabuto.
El nuevo Akatsuki informa de la muerte de Itachi Uchiha a manos de Sasuke, lo cual Tobi esperaba. Naruto grita a Zetsu que le diga dónde se encuentra su compañero, pero Tobi se despide mostrando su Sharingan ante el asombro de todos. Kakashi dice que deben ir en busca de Sasuke, por lo que pide a Hinata que mire en una dirección, donde el bosque estaba ardiendo por el Amaterasu; al confirmar sus dudas, el Escuadrón de Ocho Hombres corre hacia allí.

Kiba detecta el olor de los enemigos en el lugar de las llamas; al llegar a la linde del bosque, Yamato usa su técnica de Elemento Tierra: División Divina de la Tierra para separar el bosque, y que el Amaterasu no afectara al grupo; Kakashi prepara su Mangekyo Sharingan dispuesto a pelear con los Akatsuki; pero al llegar a la Guarida Uchiha, Tobi, Zetsu y los cuerpos de Sasuke e Itachi ya habían desaparecido; haciendo que Naruto se maldijera.
Madara es alcanzado por Amaterasu. Pero primero debe presentarse, por lo que comienza a quitarse su máscara y muestra su Sharingan derecho diciendo ser el Uchiha que conoce la verdad sobre el Clan. Al hacer esto, activa el Mangekyo Sharingan de Itachi implantado en Sasuke, por lo que el brazo de Tobi comienza a arder por el Amaterasu, pero de manera desconocida se libera de la técnica y le explica a Sasuke, que su hermano le implantó sus técnicas para intentar matarlo o para mantenerlo alejado de él, seguramente cuando le golpeó la frente antes de desplomarse. Sasuke no entiende por qué querría hacer eso, así que Tobi le explica que intentaba protegerlo, pero él se niega a creerlo.

Madara explica a Sasuke que las únicas personas de Konoha que conocían la verdad sobre Itachi eran el Tercer Hokage, sus consejeros, Homura Mitokado y Koharu Utatane, y Danzō Shimura; y que ellos se habían asegurado de ocultar la verdad en la más profunda oscuridad. El Akatsuki pide a Sasuke que recuerde todo lo que sabe sobre su hermano mayor, pero este se desmaya. Para que Sasuke lo entendiera, el Akatsuki le dice que primero deben hablar de la fundación de Konoha, cuando los Clanes se vendían para pelear por los diferentes países, pero que los más temidos eran el Clan Uchiha y el Clan Senju del Bosque, donde él nació como el más fuerte de su Clan y llegó a conseguir el Mangekyo Sharingan Eterno, por lo que su enfrentamiento con Hashirama estaba asegurado, el único hombre al que había admirado. Cada vez que un país contrataba a los Senju, su enemigo contrataba a los Uchiha; eran rivales. Pero cuanto más aumentaba la fama del Clan de Madara más enemigos tenían.
Sasuke pregunta al Akatsuki si asesinó a su hermano por ser conocido, pero este lo niega, explicando que su hermano Izuna le ofreció sus ojos.

Pero como líder del Clan Uchiha tuvo que aceptar la decisión del resto; para más adelante, hacer un pacto con el País del Fuego por el cual formarían una Aldea, comenzando con la costumbre de una Villa por País, consiguiendo una paz momentánea.

Para evitar que algún otro Uchiha se sublevara, Tobirama como Segundo Hokage ofreció al Clan Uchiha ser la Policía Militar de Konoha, pudiendo vigilarlos y mantenerlos alejados del Gobierno de Konoha. Algunos Uchiha se dieron cuenta de lo que ocurría, pero el tiempo pasaba y nada cambiaba. Pero hacía 16 años, ocurrió el ataque del Nueve Colas a la Villa, creyendo los altos cargos que fue obra de un Uchiha, aunque Madara afirma que fue una catástrofe natural. Debido a estas sospechas, el Clan Uchiha fue alejado de la población, obligados a vivir apartados; siendo Hiruzen el único que se oponía a ello.
Sasuke pregunta por qué su hermano hizo aquello, por lo que Madara le explica que Itachi participó en la Tercera Guerra Mundial Shinobi cuando aún era un crío, y a...