Tras el regreso a los muros, los miembros de las Tropas de Reconocimiento deben hacer frente a la delicada situación en la que se encuentran. Erwin debe ser juzgado debido a las numerosas bajas que sus operaciones han causado, aunque la legión sigue adelante bajo el liderazgo de Hange. Un nuevo obstáculo se presenta tras el asesinato del pastor Nick, quien tenía la clave de la presencia de titanes colosales dentro de la muralla, indicando que las Tropas de Reconocimiento no solo tienen enemigos fuera de los muros, sino también dentro.
Los soldados de la legión deben hacer frente a quienes fueron sus aliados antes de que los apuñalen por la espalda, aunque paralelamente intentarán progresar con el intento de sellar la Muralla María. Las respuestas al asesinato de Nick se encuentran en un escuadrón interno de la Policía Militar, quienes están al acecho de Eren. El nuevo escuadrón de Levi recibe órdenes de Erwin, por lo que el grupo debe moverse y engañar a sus perseguidores. El comerciante Dimo Reeves se une a la causa.
Previamente, había enviado a sus hombres para que secuestren a Eren e Historia, afortunadamente sin saber que en realidad eran Jean y Armin disfrazados. Levi, Mikasa, Connie y Sasha logran dar con ellos y así es como descubren que Reeves y sus hombres solo seguían órdenes de la Policía Militar. En conjunto, secuestran a dos de sus miembros, Djel Sanes y Ralp. El primero es torturado por Hange y Levi para obtener más información. No obstante, la aparición del despiadado Kenny Ackerman y sus hombres complicará el asunto: tras una espectacular persecución por las calles, logran hacerse con Eren e Historia y matar a Dimo Reeves, inculpando a las Tropas de Reconocimiento del crimen.
El escuadrón de Levi debe seguir el rastro a los secuestradores y atar varios cabos sueltos para llegar a Eren, quien está en manos de Rod Reiss, el verdadero líder de la monarquía y padre biológico de Historia. Kenny Ackerman resulta ser un miembro de la Policía Militar Central y el capitán del Escuadrón de Control Antipersonas. Éste se hizo infame dentro de los muros por haber asesinado a decenas de personas en el pasado, llegando a ser considerado por muchos como una leyenda urbana.
Un día, Kenny le pregunta a su abuelo moribundo por qué antiguamente el clan Ackerman era fiel y leal al rey, y en la actualidad es odiado y perseguido. El anciano le responde que no eran odiados, sino más bien temidos porque no podían ser controlados. Le explica que la mayoría de la población compartía una línea de sangre, mientras que la minoría eran los asiáticos y el clan Ackerman, quienes resultaban ser un obstáculo para el ideal del rey, que era eliminar todos los recuerdos de la humanidad antes de la era de las Murallas para establecer la paz absoluta. La familia real estaba dotada del poder de los titanes, que una vez fue usado para crear las imponentes murallas. De esta manera, pudieron limpiar los recuerdos de la mayoría y para completar el ideal debían silenciar a los clanes restantes.
Además de una inmunidad natural a la manipulación de memoria del Titán Fundador, los miembros de la familia Ackerman poseen otro rasgo único: el «poder despertado» y que, en palabras de Levi, es saber lo que hay que hacer. Este poder no despierta por sí solo y para lograr usarlo es necesario encontrar a un «anfitrión», es decir, una persona a la cual proteger, y recibir alguna orden de dicho individuo en condiciones cercanas a la muerte.
Finalmente, Eren e Historia son transportados en un ataúd hasta un lugar que, en principio, ambos desconocen, la capilla de los Reiss. Eren tiene la sensación de que ya había estado antes en ese lugar, por lo que Rod le explica que eso es producto de sus recuerdos. Cuando él e Historia tocan a Eren, en la memoria de Eren se muestran los recuerdos de una persona desconocida que entra en un pasadizo debajo de una capilla. Allí se transforma en un titán y se enfrenta a otro con forma femenina, para después masacrar a la mayoría de la familia Reiss. También ve, desde el punto de vista de su padre hace cinco años, cómo éste le inyecta un suero haciendo que Eren se transformara en titán por primera vez y lo devorara.
No obstante, Eren no es el único afectado por sus recuerdos, pues Historia también queda impactada al ver a la chica. Recuerda cómo ambas pasaron mucho tiempo juntas durante su infancia, siendo ella quien le enseñó a leer y escribir. Rod le explica a Historia que esa chica era su medio hermana, Frieda Reiss, y que ella borró todos los recuerdos de sí misma de Historia para mantenerla a salvo.
Cuando Historia le pide a su padre volver a ver a su hermana, éste les cuenta toda la verdad: ella y toda su familia fueron asesinados hace 5 años por Grisha Jaeger, quien devoró a Frieda para conseguir el poder de la Coordenada. Para que Frieda siga viva en sus recuerdos, Rod le explica a Historia que deberá inyectarse el suero para comerse a Eren y recuperar el poder que nunca les debió ser arrebatado.
Si bien inicialmente Historia está dispuesta a seguir las órdenes de su padre e inyectarse el suero, cambia de opinión, ya que ella no quiere convertirse en nadie especial. No se considera una buena persona, pero no quiere tener que devorar a alguien a quien considera un amigo. Es entonces cuando Rod Reiss decide inyectarse el suero para ser él quien devore a Eren.
Todos contemplan cómo Rod poco a poco se convierte en un titán de tamaño descomunal, que parece ser incluso mucho más enorme que el Titán Colosal. Eren piensa en transformarse, pero teme que su titán no sea lo suficientemente poderoso para proteger a sus compañeros. En ese momento ve un frasco en el maletín de Rod con la etiqueta «Acorazado Braun» y toma el líquido antes de transformarse. Más tarde, Eren despierta mientras Armin y Mikasa lo ayudan a salir de su cuerpo de titán. Para su sorpresa, se da cuenta de que fue capaz de endurecer al titán y sostener con él la estructura que estaba por derrumbarse. Eren no puede recordar cómo logró hacerlo, ya que olvidó todo a partir del momento en el que se tomó el líquido.
Pero las tropas tienen ahora un problema mayor. Rod Reiss, convertido en un titán regular de aproximadamente 120 metros, se dirige hacia el Distrito Orvud. Eren está listo para dar su vida de nuevo, pero Historia lo interrumpe al explicar que la familia Reiss trató por generaciones, sin éxito alguno, deshacer el lavado de cerebro y que Grisha probablemente robó la Coordenada para romper este control mental sobre los habitantes de las murallas. Eren recuerda las últimas palabras de Grisha, diciéndole que si quería proteger a Armin y a Mikasa, tendría que aprender a usar ese poder y que sus recuerdos le enseñarían cómo hacerlo.

Una vez que llegan al Distrito Orvud, las Tropas Estacionarias han preparado la evacuación de los civiles, pero Erwin le pide al capitán que la detenga, pues planea usar a los civiles como un señuelo para así atraer a Rod a exterior del Distrito Orvud. Tras varias rondas de cañonazos, Rod se alza sobre la muralla apoyándose sobre ella. Eren se transforma en titán después de que Armin y Sasha inutilizan las manos de Rod, haciéndole encorvarse y perder altura, luego se aproxima a la boca del titán y arroja los explosivos en su interior. El enorme cuerpo de Rod vuela en pedazos e Historia procede a cortar la parte principal, asesinándolo.
Algunas horas después de la batalla, Levi regresa a las ruinas de la capilla Reiss y halla a Kenny recostado en un árbol, siendo el único miembro de su escuadrón que ha sobrevivido tras el derrumbe de la cueva.
Dos meses después del ascenso de Historia Reiss al trono, las Tropas de Reconocimiento inician la misión para recuperar la Muralla María en el distrito Shiganshina y descubrir la verdad sobre el mundo que yace oculta en el antiguo hogar de Eren Jaeger. Tras partir del distrito Trost y viajar por el territorio de los titanes durante toda una noche, la legión consigue llegar a Shiganshina. Una vez allí se da inicio al procedimiento de sellado de los agujeros en el muro María, el cual será llevado a cabo por Eren. El bloqueo de la abertura hecha por el Titán Colosal es todo un éxito y a continuación se procede a realizar el sellado del agujero abierto por el Titán Acorazado. Las cosas se complican cuando Reiner Braun es descubierto por un soldado en el interior de la muralla. Aunque Levi intenta asesinarlo, fracasa y Reiner acaba transformándose en titán. Eren hace lo mismo en respuesta y ambos inician una batalla en el interior del distrito.

Por otro lado, el Titán Bestia aparece acompañado de varios titanes. Con ayuda de otro titán que se mueve a cuatro patas, bloquea las rutas de escape del ejército al separar a los soldados de los caballos e inicia su propio ataque al arrojar piedras dentro del distrito, matando a varios soldados. Tras escuchar el rugido de auxilio del Titán Acorazado desde Shiganshina, el Titán Bestia toma un barril en el que se encuentra Bertholdt en su interior y lo arroja hacia la ubicación de Reiner.
El Titán Bestia es derrotado por Levi gracias a un plan suicida formulado por Erwin, en el cual mueren los soldados restantes y el mismo comandante. Sin embargo, cuando Levi cree que tiene al usuario del titán apresado, aparece el misterioso titán cuadrúpedo y se lo lleva. Mientras tanto, Bertholdt en su forma de titán es vencido por Eren con la ayuda del sacrificio de Armin, quien sufre fatales quemaduras al actuar como distractor.
El usuario del Titán Bestia aparece en el lugar en el que se encuentra Eren. Éste parece conocer a su padre, pues dice que no se parece a él y le ruega que le crea, que ambos son víctimas de las acciones de Grisha Jaeger. A su vez, Reiner cae una vez más por un ataque conjunto de Hange, Mikasa y el resto. Tras su derrota, Hange le pregunta qué es el estuche de metal que trató de alcanzar antes de que le cortaran los brazos, estudiando la probabilidad de que se trate de un recurso de último minuto para suicidarse. Reiner le responde que es una carta que Ymir le confió para entregársela a Christa. Hange trata de obtener más información de Reiner, pero éste rehúsa, por lo que Hange decide cortar su cuello con una cuchilla. Antes de que pueda quitarle la vida, Jean interviene, pues pueden robar su poder de titán, tal y como dijo Erwin antes de la expedición, al tener el capitán Levi en su poder el suero y salvar así la vida de alguien.
Notando que Armin aún respira, Eren le pide a Levi el suero para salvar su vida, pero en ese momento un soldado, Floch, llega cargando en su espalda a un Erwin también gravemente herido. Al verlo Levi decide usar el suero en él. Eren rechaza la idea, por lo que Levi le dice que, mientras Erwin esté vivo, la solución más lógica es dárselo a él y en un acto de impulso golpea a Eren arrojándolo al suelo. Finalmente, Levi se queda a solas con los cuerpos de ambos, pero, cuando va a inyectarle el suero a Erwin, éste lo aparta de un manotazo. Este gesto del comandante no es a propósito, sino que lo aparta inconscientemente al estar recordando en sus últimos momentos su infancia. Y este gesto, aunque inconsciente, es suficiente para hacer cambiar de parecer a Levi. Erwin había dedicado toda su vida a justificar la creencia de su padre sobre el mundo y a explorar la verdad y, para lograr su objetivo, tuvo que deshumanizarse. Levi respeta a Erwin y sabe que morir es la única forma de poder liberarlo. Erwin se había convertido en un demonio y, a diferencia de Armin, en un esclavo de su sueño.
Eren y sus compañeros observan cómo Armin convertido en titán (quien fue inyectado con el suero por Levi) devora a un Bertholdt incapacitado y pidiendo ayuda desesperadamente, convirtiéndose así en el nuevo Titán Colosal.
Armin se come a Berthold y se transforma en Titán | Shingeki no Kyojin Temporada 3 Parte 2 6
Después, Eren junto a Mikasa, Hange y Levi llegan a las ruinas de la vieja casa de los Jaeger y una vez allí entran al sótano. Aquí descubren todo sobre el misterioso pasado de Grisha Jaeger y el verdadero origen de los titanes. Y es que la vida continúa más allá de las murallas.

Al regresar a la Muralla Rose tras haber triunfado en la misión, Eren y Mikasa son encerrados en prisión como castigo por haberse enfrentado a su superior Levi. Durante su estancia en los calabozos, Eren y Armin verifican la información encontrada en los libros de Grisha con respecto al mundo exterior y la verdadera naturaleza de los titanes, comparándolos con los recuerdos que Eren obtuvo de Grisha.
Los diez supervivientes de la misión a Shiganshina acuden a una reunión del ejército en la que también está presente la Reina Historia para discutir los resultados de la última expedición y la información conseguida sobre el mundo exterior en los libros de Grisha. Durante la conferencia, Eren piensa en aquella vez que golpeó a Dina, preguntándose por qué solo pudo usar la Coordenada en ese momento. Al recordar que Dina era una descendiente de la familia real llega a la conclusión de que, si tocara a un miembro de la realeza que ha sido transformado en titán, tal vez podría usar el poder del Titán Fundador, pero también llega a la conclusión de que decir la verdad podría poner en riesgo a Historia.
Un año después de la batalla en Trost, tras nueve meses eliminando a los titanes con ayuda de unas guillotinas instaladas en los muros, y por primera vez en seis años, las Tropas de Reconocimiento realizan una expedición al exterior de la muralla María. Durante el trayecto, se encuentran a un solo titán. Eren denota que su presencia indica que se encuentran cerca de la frontera, donde el país de Marley transforma a los eldianos en titanes. La legión llega a la frontera, y posteriormente, al océano, cumpliendo así por fin el sueño de Armin.
La tercera temporada de la serie de televisión de anime Attack on Titan fue producida por Wit Studio de IG Port y dirigida por Tetsurō Araki y Masashi Koizuka, con Yasuko Kobayashi en la composición de la serie y Kyoji Asano en los diseños de los personajes. Esta temporada cubre los arcos narrativos de la «Monarquía» (capítulos 51-70) y el «Retorno a Shiganshina» (capítulos 71-90) del manga original de Hajime Isayama. Los primeros 12 episodios de la temporada se transmitieron en NHK General TV del 23 de julio al 15 de octubre de 2018, antes de entrar en pausa hasta el 29 de abril de 2019. Adult Swim comenzó a transmitir el doblaje en inglés de Funimation el 18 de agosto de 2018. El 17 de julio de 2019, Selecta Visión lanzó en España la primera parte de la temporada en formato casero, el 15 de julio de 2020 se lanzó la segunda parte, incluyendo ambos doblaje. La temporada sigue a Eren y sus compañeros soldados de la Legión de Exploración que todavía luchan por su supervivencia contra los terroríficos Titanes. Sin embargo, las amenazas surgen no solo de los titanes más allá de las murallas, sino también de los humanos dentro de las murallas. Después de ser rescatado del Titán Colosal y el Titán Blindado, todo parece estar bien para los soldados, hasta que el gobierno de repente exige la custodia de Eren e Historia. Buscado por el gobierno, Levi y su nuevo escuadrón deben evadir a sus adversarios con la esperanza de mantener a salvo a Eren e Historia. En la segunda mitad de la temporada, la Legión de Exploración dirigida por Erwin se embarca en una misión para retomar la muralla María, regresando al destrozado distrito de Shiganshina que en donde en otro tiempo había vivido Eren. La música fue compuesta por Hiroyuki Sawano. El tema de apertura de los 12 primeros episodios de la temporada es «Red Swan» de Yoshiki junto a Hyde, y el tema final es «Akatsuki no Requiem» (暁 の 鎮魂歌 Akatsuki no Chinkonka?, lit. Descansa en este amanecer) de Linked Horizon. El tema de apertura de la segunda parte de la temporada es «Shoukei to Shikabane no Michi» (憧憬 と 屍 の 道? lit.

El vigésimo tercer capítulo del spin-off Antes de la Caída, «Del rondó de la Oscuridad», narra los sucesos posteriores al arribo al suelo, al otro lado del muro. Kyklo escucha con atención a los titanes, uno a 200 metros y otro a 300. Carlo le había dicho que usara pedernales para envar una señal una vez haya llegado al suelo. Dos chispas es señal de que la misión no se ha complicado, tres chispas seguido de otras cuatro será una señal de emergencia. Las pisadas cada vez se sienten más cercanas, Kyklo cree que es por que lo han visto, pero luego asegura que su olor los atrajo. El primero de los gigantes se lanza sobre él, pero lo esquiva haciéndose a un lado, el segundo hace lo mismo, a lo que Kyklo engancha el arpón en la cara del gigante y corta una mano, pensaba que fue un golpe eficiente, por lo que con certeza no recordó de la regeneración. Él escapa hasta el muro. Para moverse, se dirige por la nuca de uno de ellos, sin embargo, él brazo ya se había regenerado y lo envió por los aires, a ese ritmo caería y con agilidad se las arregla para clavar el filo del mandoble en el cuello del titán. El filo no se había enterrado lo suficiente en el cuello, así que el equipo no era útil, maniobra hasta llegar al suelo de nuevo y corta uno de los pies del titán, este cae y se estrella con el otro. Hace unos momentos Kyklo no había percibido ningún titán en un área de 500 metros, no sabía sin duda desde que distancia un titán podía olerlo. Él se calma, recuerda su entrenamiento, los talones de los titanes no se han recuperado del todo, tiene una posición estratégica y el titán no lo ha visto, solo ha detectado su olor. Tiene que atacar ahora; aunque no fue una atracción muy importante para el titán, pues pasó de largo.
«Sonrisa: Incursión en el Distrito Stohess 1ª Parte» (微笑み ―ストヘス区急襲①― Hohoemi ―Sutohesu Ku Kyushu (1)―?) es el episodio #23 del anime Ataque a los Titanes. Fue producido por Wit Studio y Production I.G. Annie sueña que es entrenada por su padre antes de despertar. En el Distrito Stohess de la Muralla Sina, la Policía Militar recibe órdenes de escoltar una carroza del Cuerpo de Exploración una vez que entren en la capital. Hitch se burla de Annie por haberse levantado tarde. Marlowe explicando como reformar la Policía Militar. La Policía Militar se muestra llena de perezosos y corruptos, mientras que una de los colegas de Annie, Hitch, revela que ella se unió a esa división por esa razón. Marlowe siendo golpeado por los oficiales.
Camino al punto de encuentro el escuadrón de escolta se encuentra con dos oficiales de la Policía Militar que al parecer están vendiendo el equipo comprado con el impuesto de las personas en el Mercado Negro. Marlowe intenta hablar con los oficiales acerca de la ilegalidad que éstos cometen. Lamentablemente los oficiales simplemente se ríen ya que Marlowe es sólo un soldado que está intentando desafiar a sus superiores. Marlowe al ser una persona correcta, intenta nuevamente mostrar su enojo ante la situación, tomando a uno de los oficiales por la espalda, posteriormente, recibe un golpe con una de las armas de la Policía Militar, quedando tirado en el piso.
Armin llamando a Annie desde un callejón. Después de que la carroza ha entrado al Distrito Stohess, Annie fue llamada en secreto por Armin en uno de los callejones. Armin le pide ayuda para que Eren pueda escapar de la capital, pues el supuesto Eren en la carroza es en realidad Jean. Ella se niega al principio, pero después que Armin se lo pide otra vez, diciéndole que si no lo hace, ella se convertiría en una mala persona para él, después de lo cual ella finalmente acepta. Junto con Annie, Mikasa y Eren, Armin los lleva a un túnel subterráneo. Sin embargo, Annie se niega a entrar y Armin nota que ella se comporta de forma extraña. Mikasa desenvaina una de sus cuchillas. Annie riéndose al ser descubierta.
No lo mató durante la última expedición. Eren y Armin le piden a Annie que baje con ellos al subterráneo para demostrar que están equivocados sobre ella, pero Mikasa se cansa de escucharlos y desenvaina una de sus cuchillas, llamando a Annie como la Titán Hembra. Sabiendo que su identidad se expuso, se ríe con tristeza y trata de transformarse, pero las personas que estaban ocultas salen, la aprisionan y amordazan. A pesar de eso, ella logra transformarse usando una cuchilla oculta en su anillo para herirse en un dedo.
Al inicio del episodio, Annie tiene un sueño en el que aparece entrenando con su padre, esto era en realidad un flashback del Capítulo 17 (que debería haber aparecido en el Episodio 4).
El capítulo #23 del manga Ataque a los Titanes, «La Titán Hembra», narra cómo Armin es el último sobreviviente de su grupo, y está siendo perseguido por la Titán Hembra. Ella se deshace de su caballo y se acerca a Armin, este espera que lo coma pero es sorprendido cuando esa titán solamente le saca su capucha para observar su identidad, pero aparentemente al no ser quien busca, se aleja. La Titán Hembra verifica la identidad de Armin. Reiner vio la señal de humo un rato antes y se dirige a Armin. Reiner le dice a Armin que es sólo un titán excéntrico pero el joven piensa lo contrario. Armin piensa que la Titán Hembra es alguien como Eren; un ser humano capaz de transformarse en titán. Reiner, Armin y Jean ven a lo lejos unas señales de humo, y notan que el flanco derecho fue completamente eliminado. Armin explica que todos los titanes, lo único que desean, es comer humanos. Pero, la Titán Hembra sólo verificó su rostro y corrió, eso indica un cierto nivel de inteligencia. Los jóvenes deciden distraer a la titán para que los demás ganen tiempo así la formación se arregla. Armin advierte de su inteligencia, así que les dice a Reiner y Jean que se pongan sus capuchas, ya que la Titán Hembra no correría el riesgo de matar a alguien hasta saber si es realmente a quién busca.
Jean intenta atacar a la Titán Hembra. Cuando se acercan, la titán los observa y su paso se hace más lento. Jean piensa que cortar los tendones sería muy buena idea. La Titán Hembra golpea el caballo de Armin y este sale despedido en el aire, su Equipo de Maniobras Tridimensionales se descompone y una vez más la titán se acerca para verificar la identidad de Armin. Jean intenta ayudar a Armin y se lanza contra la titán pero ella reacciona antes y lo golpea, Jean intenta atacarla a su nuca pero esta protege su punto débil con sus manos. Este es lanzado al suelo, Armin comienza a gritar que "debe vengar al chico que está muriendo" y la Titán Hembra se queda paralizada, ya que piensa que mató a Eren en su alboroto. Jean piensa que Armin ha perdido la cabeza hasta que ve a la titán distraída, lo que le permite escapar. Reiner logra escapar de la Titán Hembra. Armin sigue gritando mencionando que Eren murió a causa de la Titán Hembra. En ese momento Reiner se dirige a atacar a la titán pero justo antes de alcanzarla es atrapado por ella, empieza a apretarlo con fuerza en su puño hasta que se ve que se derrama sangre.

Un tipo único de levadura se produce en la Muralla Sina. A simple vista, parece soja fermentada del tamaño de una cabeza humana. Es de conocimiento general que almacenar la levadura en cobertizos que también contienen forraje, soja, trigo y carne curada en seco retrasa enormemente el proceso de descomposición. Es un hecho que la levadura conserva la comida al ser procesada, pero todavía no hay alguna teoría científica que lo explique.