Tu aventura en el mundo Pokémon comienza con una mudanza a Villa Raíz. Al llegar, tu madre te recibirá y verás cómo unos Machoke (o Vigoroth en Esmeralda) ayudan a instalar los muebles en tu nueva casa. Asegúrate de coger la poción del PC y poner en hora el reloj que tu padre te ha comprado. Tu madre te llamará para que veas un programa de televisión donde anuncian el gimnasio Pokémon de Ciudad Petalia, liderado por tu padre.
Tu madre te pedirá que visites al Profesor Abedul, un amigo de tu padre que vive en Villa Raíz. Al ir a su casa, conocerás a su hijo/a, tu rival, que será Aura si eres chico o Bruno si eres chica. En Pokémon Rubí y Zafiro, tu rival estará en su habitación, mientras que en Esmeralda, aparecerá al examinar una Poké Ball en el suelo o al subir y bajar las escaleras.

Al salir hacia la Ruta 101, te encontrarás con un montañero (o una niña en Esmeralda) que ha oído gritos. Al adentrarte en la ruta, escucharás al Profesor Abedul pidiendo ayuda, ya que está siendo atacado por un Poochyena (o Zigzagoon en Esmeralda). Te pedirá que cojas una Poké Ball de su mochila para defenderle.
El Pokémon que elijas será el que el Profesor Abedul te regalará. Tienes tres opciones:
- Treecko: Un Pokémon de tipo planta que se volverá muy veloz.
- Torchic: Evolucionará a un Pokémon de tipo fuego y lucha, destacando su ataque.
- Mudkip: Un Pokémon de tipo agua y tierra, que también destacará en ataque.
Tras elegir tu Pokémon, combatirás contra el atacante, que estará al nivel 2. Al derrotarlo, el profesor te explicará que estaba estudiando Pokémon en la hierba alta cuando fue atacado. Agradeciéndote tu ayuda, te entregará el Pokémon que usaste. Te informará que su hijo/a se encuentra en la Ruta 103 y te animará a ir a verle.

En la Ruta 103, encontrarás a tu rival, Bruno/Aura, estudiando Pokémon salvajes. Al verte, querrá enseñarte a entrenar y te retará a un combate. Su Pokémon será de tipo ventajoso al tuyo. Tras vencerle, huirá al Pueblo Escaso para curar a su Pokémon y luego regresará a Villa Raíz. Deberás seguirle hasta el laboratorio del profesor.
En el laboratorio, el Profesor Abedul te entregará una Pokédex, un dispositivo para registrar datos de Pokémon, y tu rival te dará cinco Poké Balls. Es recomendable capturar algunos Zigzagoon, ya que pueden encontrar objetos útiles.
Como conseguir los tres iniciales en pokemon (Ruby , Zafiro y esmeralda )
En Ciudad Petalia, deberás entrar al Gimnasio Pokémon y allí encontrarás a tu padre. Durante vuestra conversación, aparecerá Blasco, quien le pedirá a tu padre un Pokémon. Tu padre te pedirá que le acompañes para capturar uno, le dará a Blasco un Zigzagoon y una Poké Ball, y juntos se dirigirán a la Ruta 102. Allí, Blasco capturará un Ralts tras debilitarlo. Al regresar al gimnasio, Blasco devolverá el Zigzagoon a tu padre y se marchará. Tu padre te indicará que para ser un gran entrenador, debes ir a Ciudad Férrica y desafiar a la Líder de gimnasio Petra, para luego continuar tu camino y conseguir las medallas necesarias para llegar a la Liga Pokémon.
En la Ruta 104, encontrarás una playa y una casa con un puerto vacío. Más adelante, en el norte, cerca de la casa del Sr. Arenque, te encontrarás con su Wingull, Peeko. Tras rescatarle, la casa ya no estará vacía.
Es hora de dirigirse a Ciudad Férrica. Al entrar, busca objetos ocultos en el suelo. Avanzando, tendrás el primer encuentro con un soldado del Equipo Magma o Aqua, que intentará robar a un investigador de Devon S.A. Tras derrotarlo, el investigador te dará una Super Ball como agradecimiento. Continúa hacia la izquierda y encontrarás más objetos ocultos.

Al salir del Bosque Petalia por el norte y regresar a la Ruta 104, habla con un chico al lado de unas bayas para recibir la MT09 (Recurrente). Luego, entra en la floristería Pitiminí, donde te darán un cubo Wailmer y aprenderás sobre las bayas. Detrás de la floristería, encontrarás objetos ocultos.
Al salir de la floristería, ve a la derecha. Cruzarás un puente que te llevará a Ciudad Férrica. Antes de entrar, a la derecha, hay un camino que te lleva a una defensa X. En la ciudad, habla con un niño en el primer edificio gris de la izquierda para recibir una Honor Ball. En la casa de al lado del Centro Pokémon, un señor te dará la MO Corte. En la escuela Pokémon, el profesor te dará una Garra Rápida.
La primera tarea en Ciudad Férrica es desafiar a la Líder de gimnasio, Petra, especializada en Pokémon de tipo roca. Si elegiste a Treecko o Mudkip, tendrás pocas dificultades. Si elegiste a Torchic, se recomienda evolucionarlo a Combusken para que aprenda Doble Patada. También puedes capturar un Lotad (en Zafiro/Esmeralda), Wingull o Shroomish. Al ganar, obtendrás la Medalla Piedra y la MT39 Tumbarrocas.
Al salir del gimnasio, verás de nuevo al investigador de Devon S.A. huyendo de un soldado. Dirígete por el este a la Ruta 116. Al final, cerca de la entrada del Túnel Fervergal, encontrarás al Sr. Arenque, a quien le han robado su Wingull, Peeko. Dentro del túnel, derrota al soldado del Equipo Magma/Aqua para recuperar las piezas Devon y a Peeko.

Al regresar a Ciudad Férrica, el investigador de Devon te dará otra Super Ball y te llevará al edificio de Devon S.A. Allí, el Sr. Peñas te pedirá dos encargos: entregar una carta a Máximo Peñas en Pueblo Azuliza y llevar las piezas Devon al Capitán Babor en Ciudad Portual. A cambio, recibirás un Repartir Experiencia y el Pokénav, que incluye el mapa de Hoenn, información de tus Pokémon y entrenadores, entre otras funciones.
Antes de salir de Devon S.A., un trabajador te dará la función de llamar a personas importantes. Luego, te encontrarás con tu rival para un segundo combate opcional.
Ahora, rumbo a Pueblo Azuliza. Si has enseñado Corte a un Pokémon, podrás explorar nuevas zonas en el Bosque Petalia. Encontrarás objetos como una miniseta, la Semilla Milagro y una Super Ball. De vuelta en la Ruta 104, el Sr. Arenque te llevará en su barco a Pueblo Azuliza.
En Pueblo Azuliza, habla con un pescador para obtener la Caña Vieja. Dirígete a la cueva al noroeste de la isla, donde encontrarás un montañero que te dará la MO05 (Destello). Para usar Destello en la cueva Granito, necesitarás la Medalla Puño.
En el Gimnasio Pokémon de Pueblo Azuliza, te enfrentarás a su líder. Se recomienda capturar a Taillow, Ralts, Abra, Wurmple, Nincada o Sableye (en Esmeralda). Al ganar, obtendrás la Medalla Puño, la MT08 Corpulencia y control sobre Pokémon de nivel 30 o inferior.
Con Destello, podrás atravesar la cueva Granito y hablar con Máximo Peñas, quien te dará la MT47 (Ala de Acero). Con las nuevas habilidades, regresa al muelle de Pueblo Azuliza y pide al Sr. Arenque que te lleve a Ciudad Portual, cruzando las Rutas 107 y 108. Podrás ver la Nao Abandonada en la Ruta 108.
En Ciudad Portual, el Sr. Arenque te dejará en la playa. Podrás encontrar varios objetos en la orilla y hablando con algunas chicas. En la playa, habrá una casa donde lucharás contra entrenadores y un señor te dará seis Refrescos. Dirígete al astillero para encontrar al Capitán Babor. Habla con Muéllez y entra al museo, donde un soldado te dará la MT46 Ladrón.
Sube al museo y habla con el Capitán Babor. Defiéndelo de dos soldados. En Pokémon Rubí y Zafiro, entra en el edificio rojo donde se celebran concursos Pokémon y recibe el Tubo Pokécubos. En la casa de abajo, un hombre evalúa los motes de tus Pokémon. En Pokémon Esmeralda, el edificio de concursos es sustituido por una tienda de batalla, donde un marinero te dará la MT41 Tormento.
Sal de Ciudad Portual por el norte y avanza por la Ruta 110 en dirección a Ciudad Malvalona.
